>AY278741.1 SARS coronavirus Urbani, complete genome
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GGCTTAAAGTTGATACTTCTAACCCTAAGACACCCAAGTATAAATTTGTCCGTATCCAAC
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GTGCCATGAGACCTAATCATACCATTAAAGGTTCTTTCCTTAATGGATCATGTGGTAGTG
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TTTTGTTGTTTCAACTGGATACCATTTTCGTGAGTTAGGAGTCGTACATAATCAGGATGT
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CTTCTTCTTTGCTCAGGATGGCAACGCTGCTATCAGTGATTATGACTATTATCGTTATAA
TCTGCCAACAATGTGTGATATCAGACAACTCCTATTCGTAGTTGAAGTTGTTGATAAATA
CTTTGATTGTTACGATGGTGGCTGTATTAATGCCAACCAAGTAATCGTTAACAATCTGGA
TAAATCAGCTGGTTTCCCATTTAATAAATGGGGTAAGGCTAGACTTTATTATGACTCAAT
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TGTCTCTATCTGTAGTACTATGACAAATAGACAGTTTCATCAGAAATTATTGAAGTCAAT
AGCCGCCACTAGAGGAGCTACTGTGGTAATTGGAACAAGCAAGTTTTACGGTGGCTGGCA
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TCCAAAATGTGACAGAGCCATGCCTAACATGCTTAGGATAATGGCCTCTCTTGTTCTTGC
TCGCAAACATAACACTTGCTGTAACTTATCACACCGTTTCTACAGGTTAGCTAACGAGTG
TGCGCAAGTATTAAGTGAGATGGTCATGTGTGGCGGCTCACTATATGTTAAACCAGGTGG
AACATCATCCGGTGATGCTACAACTGCTTATGCTAATAGTGTCTTTAACATTTGTCAAGC
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TGTCCGCAATCTACAACACAGGCTCTATGAGTGTCTCTATAGAAATAGGGATGTTGATCA
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TGATGATGCCGTTGTGTGCTATAACAGTAACTATGCGGCTCAAGGTTTAGTAGCTAGCAT
TAAGAACTTTAAGGCAGTTCTTTATTATCAAAATAATGTGTTCATGTCTGAGGCAAAATG
TTGGACTGAGACTGACCTTACTAAAGGACCTCACGAATTTTGCTCACAGCATACAATGCT
AGTTAAACAAGGAGATGATTACGTGTACCTGCCTTACCCAGATCCATCAAGAATATTAGG
CGCAGGCTGTTTTGTCGATGATATTGTCAAAACAGATGGTACACTTATGATTGAAAGGTT
CGTGTCACTGGCTATTGATGCTTACCCACTTACAAAACATCCTAATCAGGAGTATGCTGA
TGTCTTTCACTTGTATTTACAATACATTAGAAAGTTACATGATGAGCTTACTGGCCACAT
GTTGGACATGTATTCCGTAATGCTAACTAATGATAACACCTCACGGTACTGGGAACCTGA
GTTTTATGAGGCTATGTACACACCACATACAGTCTTGCAGGCTGTAGGTGCTTGTGTATT
GTGCAATTCACAGACTTCACTTCGTTGCGGTGCCTGTATTAGGAGACCATTCCTATGTTG
CAAGTGCTGCTATGACCATGTCATTTCAACATCACACAAATTAGTGTTGTCTGTTAATCC
CTATGTTTGCAATGCCCCAGGTTGTGATGTCACTGATGTGACACAACTGTATCTAGGAGG
TATGAGCTATTATTGCAAGTCACATAAGCCTCCCATTAGTTTTCCATTATGTGCTAATGG
TCAGGTTTTTGGTTTATACAAAAACACATGTGTAGGCAGTGACAATGTCACTGACTTCAA
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TGAGAGACTCAAGCTTTTCGCAGCAGAAACGCTCAAAGCCACTGAGGAAACATTTAAGCT
GTCATATGGTATTGCTACTGTACGCGAAGTACTCTCTGACAGAGAATTGCATCTTTCATG
GGAGGTTGGAAAACCTAGACCACCATTGAACAGAAACTATGTCTTTACTGGTTACCGTGT
AACTAAAAATAGTAAAGTACAGATTGGAGAGTACACCTTTGAAAAAGGTGACTATGGTGA
TGCTGTTGTGTACAGAGGTACTACGACATACAAGTTGAATGTTGGTGATTACTTTGTGTT
GACATCTCACACTGTAATGCCACTTAGTGCACCTACTCTAGTGCCACAAGAGCACTATGT
GAGAATTACTGGCTTGTACCCAACACTCAACATCTCAGATGAGTTTTCTAGCAATGTTGC
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GGCATGCTCTCATGCAGCTGTTGATGCCCTATGTGAAAAGGCATTAAAATATTTGCCCAT
AGATAAATGTAGTAGAATCATACCTGCGCGTGCGCGCGTAGAGTGTTTTGATAAATTCAA
AGTGAATTCAACACTAGAACAGTATGTTTTCTGCACTGTAAATGCATTGCCAGAAACAAC
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CCCCCGCACATTGCTGACTAAAGGCACACTAGAACCAGAATATTTTAATTCAGTGTGCAG
ACTTATGAAAACAATAGGTCCAGACATGTTCCTTGGAACTTGTCGCCGTTGTCCTGCTGA
AATTGTTGACACTGTGAGTGCTTTAGTTTATGACAATAAGCTAAAAGCACACAAGGATAA
GTCAGCTCAATGCTTCAAAATGTTCTACAAAGGTGTTATTACACATGATGTTTCATCTGC
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GAG------GAGCCACCAAGGACAGAAGATC-----------------------------
---CTAAAATTGA---GGAGAAATCTGTCGTACAGAAGCCTATCGATGTGAAGCCAAAAA
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CTGCTTGCGTTCTTGCTGCTGAGTGTACAATTTTTAAGGATGCTATGGGCAAACCTGTGC
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------------------------------------------------------------
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CCTTTGCAGTAGACCCTGCTAAAGCATATAAGGATTACCTAGCAAGTGGAGGACAACCAA
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CACCAGAAGCTAACATGGACCAAGAGTCCTTTGGTGGTGCTTCATGCTGTCTGTATTGTA
GATGCCACATTGATCATCCAAATCCTAAAGGATTTTGTGACTTGAAAGGTAAGTACGTCC
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TAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATATGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGAC
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ATTGACCAAGTCACTATCGCTGGCGTAAAGTTGCGATCACTCAACTTGGGTGAAGTCTTC
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GTTGATAGCTTCACAAATGGAGCTGTCGTTGGCACACCAGTCTGTGTAAATGGCCTCATG
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CTTCTTACCAATATGGGTATTGATCTTGATGAATGGAGTGTGGCTACATTCTATTTGTTT
GATGATGCTGGTGAAGAAAAACTTTCTTCACGTATGTACTGTTCCTTCTATCCTCCTGAT
GATGAGGAGGATTGTGAT---GAGTATGAGGAAGAAGAGGAAGTCCCGGAAGAATCCTGT
GCGCATGAATACGGTACAGAAGAAGACTACCAAGGTCTTCCACTGGAATTTGGTGCCTCA
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GACATCGTGAAGGAGGCGCAAAACGCTAACCCCACGGTGATTGTAAATGCTGCTAACATA
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GTGCCATGAGACCTAACCATACCATTAAAGGTTCTTTCCTTAATGGATCATGTGGTAGTG
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ATAAGCACGCATTCTTGTGCTTGTTTCTGTTACCTTCTCTTGCAACAGTTGCTTACTTTA
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ACACTAGCTTGTCTGGTTATCGGCTTAAGGACTGTGTTATGTATGCTTCAGCTTTAGTTT
TGCTTATTCTCATGACAGCTCGCACTGTTTATGATGATGCTGCTAGACGTGTTTGGACAC
TGATGAATGTCATTACACTTGTTTACAAAGTCTACTATGGTAATGCTTTAGATCAAGCTA
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TCATGTTTTTAGCTAGAGCTATAGTGTTTGTGTGTGTTGAGTATTACCCATTGTTATTTA
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TACTGCTCTCGGTTCTTCAACAACTTAGAGTAGAGTCATCTTCTAAATTGTGGGCACAAT
GTGTACAACTCCACAATGATATTCTTCTTGCAAAAGACACAACTGAAGCTTTCGAGAAGA
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GCGAGGAAATGCTCGACAACCGTGCTACTCTTCAGGCTATTGCTTCAGAATTTAGTTCTT
TACCATCATATGCCGCTTATGCCACTGCCCAAGAGGCCTATGAGCAGGCTGTAGCTAATG
GTGATTCTGAAGTCGTTCTCAAAAAGTTAAAGAAATCTTTGAATGTGGCTAAATCTGAGT
TTGACCGTGATGCTGCCATGCAACGCAAGTTGGAAAAGATGGCAGATCAGGCTATGACCC
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CAATGCTTTTCACTATGCTTAGGAAGCTTGATAATGATGCACTTAACAACATTATCAACA
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TGGTTGTTGTCCCTGATTATGGTACCTACAAGAACACTTGTGATGGTAACACTTTTACAT
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TTAGTGAAATTAACATGGATAATTCACCAAATTTGGCTTGGCCTCTTATTGTTACAGCTC
TAAGAGCCAACTCAGCTGTCAAACTACAGAATAATGAACTGAGTCCGGTAGCACTACGAC
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TCAAAGGCTTAAATAACCTAAATAGAGGTATGGTTCTGGGCAGTTTAGCTGCTACAGTAC
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CCTTTGCAGTAGACCCTGCTAAAGCATATAAGGATTACCTAGCAAGTGGAGGACAACCAA
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GATGCCACATTGATCATCCAAATCCTAAAGGATTTTGTGACTTGAAAGGTAAGTACGTCC
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TGACACATTAAAAGAAATACTCGTCACATACAATTGTTGTGATGATGATTATTTCAATAA
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AGGCATTGTAGGCGTACTGACATTAGACAATCAGGATCTTAATGGGAACTGGTACGACTT
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CATGCATGCAGCTTCTGGCAATTTATTGCTAGATAAACGCACTACATGCTTTTCAGTAGC
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CTTTGATTGTTACGATGGTGGCTGTATTAATGCCAACCAAGTAATCGTTAACAATCTGGA
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TGCGCAAGTATTAAGTGAGATGGTCATGTGTGGCGGCTCACTATATGTTAAACCAGGTGG
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TGATGATGCCGTTGTGTGCTATAACAGTAACTATGCGGCTCAAGGTTTAGTAGCTAGCAT
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CAAGTGCTGCTATGACCATGTCATTTCAACATCACATAAATTAGTGTTGTCTGTTAATCC
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TGAGAGAATCAAACTCTTTGCAGCAGAAACACTCAAAGCTACTGAGGAAACATTCAAGCT
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GACATCTCACACTGTAATGCCACTTAGTGCACCTACTCTAGTGCCACAAGAGCACTATGT
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AGATAAATGTAGTAGAATCATACCTGCGCGTGCTCGCGTAGAGTGTTTTGACAAATTCAA
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TGCTGATATTGTAGTCTTTGATGAAATCTCTATGGCTACTAATTATGACTTGAGTGTTGT
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CCCGCGCACATTGCTGACCAAAGGCACACTAGAACCAGAATACTTCAATTCAGTGTGCAG
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GTCAGCTCAATGCTTCAAAATGTTTTACAAGGGTGTTATTACACATGATGTTTCATCTGC
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ATTGCCTACGCAGACTGTTGATTCCTCACAGGGTTCTGAGTATGACTATGTCATATTCAC
GCAAACTACCGAAACAGCACACTCTTGCAATGTTAACCGCTTTAATGTGGCTATCACAAG
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TACAAGTCTAGAAGTACCACGCCGCAATGTGGCTACATTACAGGCAGAAAATGTAACTGG
ACTTTTTAAGGACTGTAGTAAGATCATCACCGGTCTTCATCCAACACAGGCACCTACACA
CCTCAGCGTTGATACAAAATTTAAGACTGAGGGACTATGTGTTGACATACCAGGCATACC
AAAGGACATGACCTACCGTAGACTCATCTCTATGATGGGTTTCAAAATGAATTACCAAGT
TAATGGTTACCCTAATATGTTTATTACCCGCGAGGAAGCTATTCGTCACGTTCGTGCATG
GATTGGCTTCGACGTAGAGGGCTGTCATGCAACTAGAGATGCTGTGGGTACTAACCTACC
TCTCCAGCTAGGATTTTCTACAGGTGTTAATTTAGTAGCTGTACCAACTGGCTATGTTGA
CACTGAAAATAACACAGAATTCACCAGAGTTAATGCAAAACCTCCACCAGGTGATCAATT
TAAACATCTTATACCACTCATGTACAAAGGCTTGCCCTGGAATGTAGTGCGTATTAAGAT
AGTACAAATGCTCAGTGATACACTGAAAGGATTGTCAGACAGAGTCGTGTTTGTCCTCTG
GGCGCATGGCTTTGAGCTTACATCAATGAAGTACTTTGTCAAGATTGGACCTGAGAGAAC
GTGTTGTCTGTGCGACAAACGTGCAACTTGCTTTTCTACTTCATCAGACACTTATGCCTG
CTGGAATCATTCTGTGGGTTTTGACTATGTCTACAACCCATTTATGATTGATGTTCAGCA
GTGGGGTTTTACGGGTAACCTTCAGAGTAACCACGACCAACATTGTCAAGTGCATGGAAA
TGCACATGTGGCTAGTTGTGATGCTATCATGACTAGATGCTTGGCAGTCCATGAGTGCTT
TGTTAAGCGCGTTGATTGGTCTGTTGAATACCCTATTATAGGAGATGAACTGAAGATTAA
TTCTGCTTGCAGAAAAGTACAGCATATGGTTGTAAAGTCTGCATTGCTTGCTGATAAGTT
TCCAGTTCTTCATGACATTGGAAATCCAAAGGCTATCAAGTGTGTGCCTCAGGCTGAAGT
AGAATGGAAGTTCTATGACGCTCAGCCATGCAGTGACAAAGCCTACAAAATAGAGGAACT
CTTCTATTCTTATGCTACACATCATGATAAATTCACTGATGGTGTTTGTTTGTTTTGGAA
CTGTAACGTTGATCGTTACCCAGCCAATGCAATTGTGTGTAGGTTTGACACCAGAGTTTT
GTCAAACTTGAACTTACCGGGTTGTGATGGTGGTAGTTTGTATGTGAACAAGCATGCATT
CCACACCCCAGCTTTTGATAAAAGTGCATTTACTAATTTAAAGCAATTGCCTTTCTTTTA
TTATTCTGATAGTCCTTGTGAGTCTCATGGCAAACAAGTAGTGTCAGATATTGATTACGT
ACCACTTAAATCAGCTACGTGTATTACACGTTGCAATTTGGGTGGTGCTGTTTGCAGACA
CCATGCAAATGAGTACCGACAGTACTTAGATGCATACAACATGATGATTTCTGCTGGATT
TAGCCTATGGATTTACAAACAGTTTGATACTTATAACCTGTGGAATACATTTACCAGGTT
ACAAAGCTTAGAAAATGTGGCTTACAATGTTGTTAATAAAGGACACTTCGATGGACAAGC
TGGTGAAGCACCTGTTTCCATCATCAATAATGCTGTTTACACAAAGGTAGATGGTGTTGA
TGTAGAGATCTTTGAAAACAAGACAACACTTCCTGTTAATGTTGCATTTGAGCTTTGGGC
TAAGCGTAACATTAAACCAGTGCCAGAGATTAAGATACTCAATAATTTGGGTGTCGATAT
CGCTGCTAATACTGTGGTCTGGGACTATAAGAGAGAAGCACCAGCACATATGTCAACAAT
AGGTGTCTGCACAATGACTGACATTGCTAAGAAACCTACTGAGAGTGCTTGTTCCTCGCT
TACTGTCTTATTTGATGGTAGAGTGGAAGGACAGGTAGACCTTTTTAGAAATGCCCGTAA
TGGTGTTTTAATAACAGAAGGTTCAGTTAAAGGTTTAACACCTTCAAAGGGGCCAGCACA
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TAAGAAAGTAGATGGCATTATTCAACAGCTGCCTGAAACCTACTTTACTCAGAGCCGAGA
CTTAGAGGATTTTAAGCCCAGATCACAAATGGAAACTGACTTTCTCGAGCTCGCTATGGA
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TTTCAGTCATGGACAACTTGGCGGCCTTCATTTAATGATTGGTTTAGCCAAGCGTTCACA
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CATAACAGATGCACAAACAGGTTCATCAAAATGTGTGTGTTCTGTCATTGACCTCTTGCT
TGACGACTTTGTTGAGATAATAAAGTCACAGGATTTGTCAGTAATCTCTAAGGTAGTCAA
GGTTACAATTGACTACGCTGAGATTTCATTCATGCTTTGGTGTAAAGATGGTCATGTCGA
AACCTTCTACCCAAAATTACAGGCAAGTCAAGCATGGCAACCGGGAGTTGCGATGCCTAA
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TGCTGTCATACCAAAGGGAATAATGATGAATGTCGCAAAATACACTCAACTGTGTCAATA
CTTAAACACACTTACTTTAGCTGTACCCTACAACATGAGAGTTATTCACTTTGGTGCTGG
CTCTGATAAAGGAGTTGCACCTGGTACAGCTGTACTCAGGCAGTGGTTGCCAACTGGCAC
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CCCTAAGACAAAACATGTGACAAAAGAGAATGACTCAAAAGAAGGGTTTTTCACTTACCT
GTGTGGATTTATAAAGCAAAAGCTAGCCTTGGGTGGCTCTGTGGCTGTGAAGATAACAGA
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TGTGGCTATTATTGTTAAGCATTTGCTTAGGTTCACTAATCTATGTAACTGCAGCTTTAG
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GTTTAAGTGGATTAGATTCGCTTGATTCCTATCCAGCTCTTGAAACCATTCAGGTGACGA
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CTGCTGGATGGACATTTGGTGCTGGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGG
CATATAGGTTCAATGGCATTGGAGTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAA
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CTGGGAGTTGTGATGTCGTAATTGGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAAC
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------------------------------------------------------------
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------------------------------------------------------------
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GGCCCAGAAGCTTCACTTCCCTACGGCGCTAACAAAGAAGGCATCGTATGGGTCGCAACT
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GCCACCGTGCTACAACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAGGGG
AGCAGAGGCGGCAGTCAAGCCTCTTCTCGCTCTTCATCACGTAGTCGCGGTAATTCAAGA
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TGTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTAC
GATCGAGGGTACAGTGAATAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTG
TAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGAC
---------------------------------
>KY417147.1 Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4237, complete genome
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GTTCTCTAAACGAACTTTAAAA------TCTGTGTAGCTGTCGCTCGGCTGCATGCCTAG
TGCACCTACGCAGTATAAACAATAATAAATTTTACTGTCGTTGACAAGAAACGAGTAACT
CGTCCCTCTTCTGCAGACTGCTTACGGTTCCGTCCGTGTTGCAGTCGATCATCAGCATAC
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GAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTGCCTGTTCTTCAGGTTAGAGACGTGCTAGTGCGT
GGCTTCGGGGACTCTGTGGAAGAGGCCCTATCGGAGGCACGTGAACATCTTAAAAATGGC
ACTTGTGGTTTAGTGGAGCTGGAAAAAGGCGTACTGCCCCAGCTTGAACAGCCCTATGTG
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GGAGCCGGTGGCCATAGCTTTGGCATCGATCTAAAGTCTTATGACTTAGGTGACAAGCTT
GGCACTGATCCCATTGAAGATTACGAACAAAACTGGAACACTAAGCATGGCAGTGGTGCA
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GTGCCATGAGACCTAATCATACCATTAAAGGTTCTTTCCTTAATGGATCATGTGGTAGTG
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TGCTTATTCTCATGACAGCTCGTACTGTTTATGATGATGCTGCTAGACGTGTTTGGACAC
TGATGAATGTCATTACACTTGTTTACAAAGTCTACTATGGTAATGCTTTAGACCAAGCTA
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AACATCATCCGGTGATGCTACAACTGCTTATGCTAATAGTGTCTTTAACATTTGTCAAGC
TGTTACAGCCAATGTAAATGCACTCCTTTCAACTGATGGTAACAAGATAGCTGACAAGTA
TGTCCGCAATCTACAACACAGGCTTTATGAGTGTCTCTATAGAAATAGGGATGTTGATCA
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TGATGACGCCGTTGTGTGCTACAACAGTAACTACGCGGCTCAAGGTTTAGTAGCTAGCAT
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CTGGACTGAGACTGACCTTACTAAAGGACCTCACGAATTTTGCTCACAGCATACAATGCT
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TGTCTTTCACTTGTATTTACAATACATTAGGAAGTTACATGATGAGCTTACTGGTCACAT
GCTAGACATGTATTCTGTAATGCTAACTAATGATAACACCTCACGGTACTGGGAACCTGA
GTTTTATGAAGCTATGTACACACCACACACAGTCTTGCAGGCTGTAGGTGCTTGTGTATT
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CAAGTGCTGCTATGATCATGTCATTTCAACATCGCATAAATTAGTGTTGTCTGTTAATCC
CTATGTTTGCAATGCTCCAGGTTGTGATGTCACTGATGTGACACAACTATATCTAGGAGG
TATGAGCTATTATTGCAAGTCACATAAGCCTCCCATTAGTTTTCCATTGTGTGCTAATGG
TCAGGTTTTTGGTTTATATAAGAACACATGTGTAGGTAGTGACAATGTCACTGACTTCAA
TGCGATAGCAACATGTGATTGGACTAATGCTGGCGATTATATACTTGCCAACACTTGTAC
TGAGAGACTCAAGCTCTTTGCAGCAGAAACGCTCAAAGCTACTGAGGAAACATTTAAGCT
GTCATATGGTATTGCCACTGTACGTGAAGTACTCTCTGACAGAGAATTGCATCTTTCATG
GGAGGTTGGAAAACCTAGACCACCGTTGAATAGAAATTATGTCTTTACTGGTTACCGTGT
AACTAAAAATAGTAAAGTACAGATTGGAGAGTACACTTTTGAAAAGGGTGACTACGGTGA
TGCTGTTGTGTATAGAGGTACTACAACATACAAATTGAATGTTGGTGATTACTTTGTGTT
AACATCTCACACTGTAATGCCACTTAGTGCACCTACTCTAGTGCCACAAGAGCACTATGT
GAGAATTACTGGCTTGTACCCAACACTCAACATTTCAGATGAGTTTTCTAGCAATGTTGC
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AGATAAATGTAGTAGAATCATACCTGCGCGTGCGCGCGTAGAGTGTTTTGATAAATTCAA
AGTGAATTCAACACTAGAACAGTATGTTTTCTGCACTGTAAATGCATTGCCAGAAACAAC
TGCTGACATTGTGGTCTTTGATGAAATCTCTATGGCCACTAATTATGACTTGAGTGTTGT
CAATGCTAGACTTCGTGCAAAACACTACGTCTATATTGGCGATCCTGCTCAATTACCAGC
TCCCCGCACATTGCTGACTAAAGGCACACTAGAACCAGAATACTTTAATTCAGTGTGCAG
ACTTATGAAAACAATAGGTCCAGACATGTTCCTTGGAACTTGTCGCCGTTGTCCTGCTGA
AATTGTCGACACTGTGAGTGCTTTAGTTTATGATAATAAGCTAAAAGCACACAAGGATAA
GTCAGCTCAATGCTTCAAAATGTTTTACAAAGGTGTTATTACACATGATGTTTCATCTGC
AATTAATAGACCTCAAATAGGTGTTGTAAGAGAATTTCTTACACGCAATCCTGCTTGGAG
AAAAGCTGTTTTTATCTCACCTTATAATTCACAGAATGCTGTAGCTTCAAAAATCTTAGG
ATTGCCTACGCAGACTGTTGATTCCTCACAGGGTTCTGAGTATGACTATGTCATATTCAC
ACAAACTACCGAAACAGCACACTCTTGTAATGTTAACCGCTTTAATGTGGCTATCACAAG
AGCAAAAATTGGCATTTTGTGCATAATGTCTGATAGAGATCTTTATGACAAACTGCAATT
CACAAGTCTAGAAGTACCACGCCGTAATGTGGCTACATTACAGGCAGAAAATGTAACTGG
ACTTTTTAAGGACTGTAGTAAGATCATTAACGGTCTTCATCCAACACAGGCACCTACACA
CCTCAGCGTTGATACAAAATTTAAGACTGAGGGACTATGTGTTGACATACCAGGCATACC
AAAGGACATGACCTATCGTAGACTCATCTCTATGATGGGTTTCAAAATGAATTACCAAGT
CAATGGTTACCCTAACATGTTTATCACCCGCGAAGAAGCTATTCGTCACGTTCGTGCATG
GATTGGCTTCGACGTAGAGGGCTGTCATGCAACTAGAGATGCTGTGGGTACTAACCTACC
TCTCCAGCTAGGATTTTCTACAGGTGTTAACTTAGTAGCTGTACCGACTGGCTATGTTGA
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TAAACATCTTATACCACTCATGTACAAAGGCTTGCCCTGGAATGTAGTGCGTATTAAGAT
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GGCGCATGGCTTTGAGCTTACATCAATGAAGTACTTTGTCAAGATTGGACCTGAAAGAAC
GTGCTGTCTGTGTGACAAACGTGCAACTTGCTTTTCTACTTCATCAGATACTTATGCCTG
CTGGAATCATTCTGTGGGTTTTGACTATGTCTACAACCCATTTATGATTGATGTTCAGCA
GTGGGGTTTTACGGGTAACCTTCAGAGTAACCACGACCAACATTGTCAAGTGCATGGAAA
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TGTTAAGCGCGTTGATTGGTCTGTTGAATACCCCATTATAGGAGATGAACTGAAGATTAA
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TCCAGTTCTTCATGACATTGGAAATCCAAAGGCTATCAAGTGTGTGCCTCAGGCTGAAGT
AGAGTGGAAGTTCTATGACGCTCAGCCATGCAGTGACAAAGCCTACAAAATAGAGGAACT
TTTCTATTCTTATGCTACACATCATGATAAATTCACTGATGGTGTTTGTTTGTTTTGGAA
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GAG------GAGCCACCAAAGACAGAAGATC-----------------------------
---CTAAAATTGA---GGAGAAATCTGTCGTACAGAAGCCTGTCGATGTGAAGCCAAAAA
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ATGTGACACATGGTTTTAATCTTGAAGAGGCTGCGCGCTGTATGCGTTCTCTTAAAGCTC
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CTTTCGAGTACTACCACACTCTTGATGAGAGTTTTCTTGGTAGGTACATGTCTGCTTTAA
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------------------CTCGTGGCACACAACAATCATCTTGGGTTTATCAGAGTGCGT
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G---AAATTTTAAAGACTTACGTGAGTATGTCTTTAAGAATCGGGATGGTTTTCTTAGTG
TTTACCAAACTTATACAGCTGTTAATTTACCTAGGGGATTACCTACTGGGTTTTCAGTTT
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CT------------------ATGTTTAGTCAAACTACTTCTAATTTCTTACCAGAAAGTG
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-------------CACTGGCCATTATTATTATAGATCTCACCGTAAGACTAAGCTCAAGC
CTTTTGAGAGAGATCTATCG---------------TCTGATGATGG--------------
----------TAATGGTGTATACACACTTAGTACTTATGACTTCAACCCTAACGTACCAG
TAGCATATCAGGCCACTAGAGTTGTTGTTCTTTCTTTTGAACTTCTTAATGCACCCGCAA
CAGTTTGTGGACCTAAATTGTCTACACAACTAGTTAAGAACCAGTGTGTTAATTTTAACT
TCAATGGACTCAAGGGCACTGGTGTTTTGACTGACTCATCAAAGAGGTTTCAGTCTTTTC
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---TACGTAGTGTAGGTCAGAAATCCATTGTGGCTTACACTATGTCTTTGGGTGCAGAAA
ATTCTATTGCTTACGCTAATAACTCAATTGCCATACCTACAAATTTTTCAATTAGTGTCA
CGACTGAAGTGATGCCAGTTTCAATGTCTAAGACATCAGTAGATTGTACAATGTACATCT
GTGGTGACTCTCAGGAGTGCAGTAATTTACTTCTTCAATACGGAAGTTTCTGCACGCAAT
TAAATCGTGCTCTTACGGGCATTGCCATAGAACAGGATAAAAATACACAGGAGGTTTTTG
CCCAGGTTAAACAAATGTACAAGACACCAGCCATAAAGGATTTTGGCGGTTTCAATTTTT
CACAAATATTGCCCGATCCTTCAAAGCCAACAAAGAGATCATTTATTGAAGACCTACTCT
TCAACAAGGTGACTCTCGCTGATGCTGGCTTTATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTG
ATATTAATGCTAGAGATCTCATTTGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCAC
CTCTACTCACAGATGACATGATTGCTGCATACACTGCTGCCCTTGTCAGTGGTACTGCTA
CTGCTGGTTGGACGTTCGGTGCTGGTGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAGATGG
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ATCTTGCTGCTACTAAAATGTCTGAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTCT
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TGAAAGAGCTGCTGCAGAATGGTATGAATGGTCGTACTATCCTTGGTAGCACTATTTTAG
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------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
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------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
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GAGGGAGCCTTGAACACACCTAAAGATCACATTGGCACCCGCAATCCTAATAACAATGCT
GCCACCGTGCTACAACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAAGGG
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CTTTGATTGTTACGATGGTGGCTGTATTAATGCCAACCAAGTAATCGTTAACAATCTGGA
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TGTCTCTATCTGTAGTACTATGACAAATAGACAGTTTCATCAGAAATTATTGAAGTCAAT
AGCCGCCACTAGAGGAGCTACTGTGGTAATTGGAACAAGCAAGTTTTACGGTGGCTGGCA
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TCCAAAATGTGACAGAGCCATGCCTAACATGCTTAGGATAATGGCCTCTCTTGTTCTTGC
TCGCAAACATAGCACTTGCTGTAACTTGTCACACCGTTTCTACAGGTTAGCTAATGAGTG
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TGTTACAGCCAATGTAAATGCACTCCTTTCAACTGATGGTAACAAGATAGCTGACAAGTA
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TGATGATGCCGTCGTGTGCTACAACAGTAACTACGCGGCTCAAGGTTTAGTAGCTAGCAT
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CTGGACTGAGACTGACCTTACCAAAGGACCTCACGAATTTTGCTCACAGCATACAATGCT
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TGTGTCATTAGCTATTGATGCCTACCCCCTTACTAAACATCCTAATCAGGAGTATGCTGA
CGTCTTTCACTTGTATTTACAATACATTAGGAAGTTACATGATGAGCTTACTGGTCACAT
GCTAGACATGTATTCTGTAATGCTAACTAATGATAACACCTCACGGTATTGGGAACCTGA
GTTTTATGAAGCTATGTACACACCACACACAGTCTTGCAGGCTGTAGGTGCTTGTGTATT
GTGTAATTCACAGACCTCACTTCGTTGCGGTGCTTGCATTAGGAGACCATTCCTGTGCTG
CAAGTGCTGCTATGACCATGTCATTTCAACATCACATAAATTAGTATTGTCTGTTAATCC
CTATGTTTGCAATGCACCAGGTTGTGATGTCACTGACGTGACACAACTATATCTAGGAGG
TATGAGCTATTACTGCAAGTCACATAAGCCTCCCATTAGTTTTCCATTGTGTGCTAATGG
TCAGGTTTTTGGTTTATACAAGAACACATGTGTAGGTAGTGATAATGTCACTGACTTCAA
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TGAGAGACTCAAGCTCTTTGCAGCAGAAACGCTCAAAGCTACTGAGGAAACATTTAAGCT
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TGCTGTTGTGTACAGAGGTACTACAACATACAAATTGAATATTGGTGATTACTTTGTGTT
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GAGAATTACTGGCTTGTACCCAACACTTAATATCTCAGATGAGTTTTCTAGCAATGTTGC
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GGCATGCTCTCATGCAGCTGTTGATGCCCTATGTGAAAAGGCATTAAAATATTTGCCCAT
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AATTAACAGACCTCAAATAGGCGTTGTAAGAGAATTTCTTACACGCAATCCTGCTTGGAG
AAAAGCTGTTTTTATCTCACCTTATAATTCACAGAATGCTGTAGCTTCAAAAATCTTAGG
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TAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGAC
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>KJ473815.1 BtRs-BetaCoV/GX2013, complete genome
------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
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GAAGCA------------------------------------------------------
------------GAACCTGAACCAGAACCTCTACCTGAAGAACTAGTTAACCAG------
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GACATCGTTAAGGAGGCGCAAAACGCTAATCCCACGGTGATTGTAAATGCTGCTAACATA
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ATGTGCGTGCAGACAGTTCGTACACAGGTTTATATTGCAGTCAATGACAAAGCTCTTTAT
GAGCAGGTTGTCATGGATTACCTTGACAGCCTGAAGCCTAGAGTGGAAACACTTAAACAA
GAG------GAGTTACCAAAGGCAGAAGACC-----------------------------
---CTAAAGTTCA---GGAGAAATCTGTCGTACAAAAAACTGTTGATGTGAAGCCAAAAA
TTAAGGCTTGCATTGATGAGGTCACCACAACATTGGAAGAAACTAAGTTTCTTACCAATA
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CATTTTACGTGCTACCTTCAGAAACACCTAATGCTAAGGAAGAGATTCTAGGAACTGTAT
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GCATGGATGTTAGAGCCATAATGGCCACCATCCAACGCAAGTACAAAGGAATTAAAATTC
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CTGCTGTAGTGTCAGTATCATCACCAGATGCTGTTACTACATATAATGGATACCTCACTT
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------------------GTAGAGGTACACAACAGAATTCTTGGGTTTATCAAAGTGCAT
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-------------CACTGGCAATTATTATTACAGATCGCATCGCAAGACTAAATTAAAGC
CTTTTGAGAGAGATCTGTCT---------------TCCGATGATGG--------------
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ACTCATTCGTTTCGGAAGAGACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGTACTTCTTTTTCTTG
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TTAAAAATCTGAACTCTTCTGAAGGAGTTCCTGATCTTCTGGTCTAAACGAACTAACTAT
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TACTGTTGAAGAGCTTAAGCAGCTCTTGGAACAATGGAACCTAGTAATAGGATTCCTTTT
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TGCTGTTTACAGAATTAATTGGGTGACTGGCGGGATTGCAATTGCAATGGCTTGTATTGT
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TATGTGGTCATTCAATCCAGAAACTAACATTCTTCTCAATGTGCCTCTTCGGGGAACAAT
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CCTGCGAATGGCTGGACACTCTCTAGGGCGCTGTGACATCAAGGACCTGCCAAAAGAGAT
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TTCATCTAGTTGACTTCCAGGTTACAATAGCAGAGATATTGATTATCATTATGAGGACTT
TCAGGATTGCCATCTGGAATCTTGATGTAATAATAAGTTCAATAGTGAGACAATTATTTA
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ATCCATA-----------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
---------------------------------------------------AAACGAACA
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AGGAGTGTGTTAGAGGTACAACTGTACTATTAAAAGAACCTTGCCCATCAGGAACGTACG
AGGGCAATTCACCATTTCACCCTCTTGCTGACAACAAATTTGCACTAACTTGCATTAGCA
CACATTTTGCTTTTGCTTGTGCTGACGGTACTCGACATACCTATCAGCTTCGTGCAAGAT
CAGTTTCTCCAAAACTCTTCATCAGGCAAGAGGAAGTTCATCAAGAGCTCTATTCACCAC
TTTTTCTCATTGTTGCCGCTCTAGTATTTATAATACTTTGCTTCACCATTAAGAGAAAGA
CCGAATGAGTGAGCTCACTTTAATTGACTTCTATTTGTGCTTTTTAGCCTTTCTGCTATT
CCTTGTTTTAATAATGCTCATCATATTTTGGTTCTCCTTGGAGATTCAAGATTCTGAAGA
GCCATGTCCAAAAGTCTAAACGAACATGAAACTTCTCATTGTTTTTGGACTCTTAACAAT
AGTGTATGGTATGCATAAGGAATGCACCATACAAGAGTGTTGTGAA---AATCAACCCTA
CATTCTAGAAGATCCCTGTCCAATACACTACTATTCGGACTGGTATTTA------AAGAT
TGGACCAAGAAAGTCGGCCCGCTTACTTCAGCTTTGTGCTGGTGAGTATGGCAAAAGACT
ACCGGTTCAGTATGAGAAGCTTGGCAACTATAC-TATCAACTGTGAACCATTTGAAATTA
ATTGCCAAACACCACCTGTAGGCAGTCTAATTGTGCGTTGTTCGTACGATTATGACTTCA
TTGAG-----------------TATCACGACGTTCGTGTTGTTCTAGATTTCATCTAAAC
GAACAAACTAAAATGTCTGATAATGGACCCCAACAAAACCAACGTAGTGCCCCCCGCATT
ACATTTGGTGGACCCACAGATTCAGCTGACAATAACCAGGATGGAGGACGCAGTGGTGCG
CGGCCAAAACAACGCCGACCTCAAGGTTTACCCAATAATACTGCGTCTTGGTTCACAGCT
CTCACTCAGCATGGCAAGGAGGAACTTAGATTCCCTCGAGGCCAGGGCGTTCCAATCAAC
ACCAATAGTGGTAAAGATGACCAAATTGGCTACTACCGAAGAGCTACCCGACGAGTTCGT
GGTGGTGACGGCAAAATGAAAGAGCTCAGCCCCAGATGGTACTTCTATTACCTAGGAACT
GGCCCAGAAGCTTCACTTCCCTACGGCGCTAACAAAGAAGGCATCGTATGGGTTGCAATT
GAGGGAGCCTTGAATACACCAAAAGATCACATCGGCACCCGCAATCCTAATAACAATGCT
GCCATCGTGCTACAACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAGGGA
AGCAGAGGCGGCAGTCAAGCCTCTTCTCGCTCCTCATCACGTAGTCGTGGTAATTCAAGA
AATTCAACTCCTGGCAGCAGTAGGGGAAATTCTCCTGCTCGAATGGCTAGCGGAGGTGGT
GAAACTGCCCTCGCGCTATTGCTGCTAGACAGATTGAACCAGCTAGAGAGCAAAGTTTCT
GGTAAAGGCCAACAACAACAAGGCCAGACTGTCACTAAGAAATCTGCCGCTGAGGCATCT
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ACTGATTACAAACATTGGCCGCAAATTGCACAATTTGCTCCAAGTGCCTCTGCATTCTTC
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>KF569996.1 Rhinolophus affinis coronavirus isolate LYRa11, complete genome
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CTTCTTCTTTGCTCAGGATGGCAATGCTGCTATCAGTGATTATGACTATTATCGTTATAA
TCTGCCAACAATGTGTGATATCAGACAACTCCTATTCGTAGTTGAAGTTGTTGATAAATA
CTTTGATTGTTACGATGGTGGCTGTATTAATGCCAACCAAGTAATCGTTAACAATCTGGA
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AACTCAAATGAATCTTAAGTATGCCATTAGTGCAAAGAATAGAGCTCGCACCGTAGCTGG
TGTCTCTATCTGTAGTACTATGACAAATAGACAGTTTCATCAGAAATTATTGAAGTCAAT
AGCCGCCACTAGAGGAGCTACTGTGGTAATTGGAACAAGCAAATTTTACGGTGGCTGGCA
TAACATGTTAAAAACTGTTTACAGTGATGTAGAAACTCCACACCTTATGGGTTGGGATTA
TCCAAAATGTGACAGAGCCATGCCTAACATGCTTAGGATAATGGCCTCTCTTGTTCTTGC
TCGCAAACATAGCACTTGCTGTAACTTGTCACACCGTTTCTACAGGTTAGCTAATGAGTG
TGCGCAGGTGTTAAGTGAGATGGTCATGTGTGGCGGCTCACTATATGTTAAACCAGGTGG
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TGAATTCGTGGATGAGTTTTACGCTTACCTGCGTAAACATTTCTCCATGATGATTCTTTC
TGATGATGCCGTTGTGTGCTATAACAGTAACTACGCGGCTCAAGGTTTAGTAGCTAGCAT
TAAGAACTTTAAGGCAGTTCTTTATTATCAAAATAATGTGTTCATGTCTGAGGCAAAATG
CTGGACTGAGACTGACCTTACTAAAGGACCTCACGAATTTTGCTCACAGCATACAATGCT
AGTTAAACAAGGAGATGACTACGTGTACCTGCCTTACCCAGATCCATCAAGAATATTAGG
CGCAGGCTGTTTTGTCGATGATATTGTCAAAACAGATGGTACACTTATGATTGAGAGGTT
TGTGTCATTAGCTATTGATGCCTACCCCCTTACTAAACATCCTAATCAGGAGTATGCTGA
TGTCTTTCACTTGTATTTACAATACATTAGGAAGTTACATGATGAGCTTACTGGTCACAT
GCTAGACATGTATTCTGTAATGCTAACTAATGATAACACCTCACGGTATTGGGAACCTGA
GTTTTATGAAGCTATGTACACACCACACACAGTCTTGCAGGCTGTAGGTGCTTGTGTATT
GTGTAATTCACAGACCTCACTTCGTTGCGGTGCCTGCATTAGGAGACCATTCCTGTGCTG
CAAGTGCTGCTATGACCATGTCATTTCAACATCACATAAATTAGTGTTGTCTGTTAACCC
CTATGTTTGCAATGCACCAGGTTGTGATGTCACTGACGTGACACAACTATATCTAGGAGG
TATGAGCTATTACTGCAAGTCACATAAGCCTCCCATTAGTTTTCCATTGTGTGCTAATGG
TCAGGTTTTTGGTTTATACAAGAACACATGTGTAGGTAGTGACAATGTCACTGACTTCAA
TGCTATAGCAACATGTGACTGGACTAATGCTGGCGATTATATACTTGCCAACACTTGTAC
TGAGAGACTCAAGCTCTTTGCAGCAGAAACGCTCAAAGCTACTGAGGAAACATTCAAGCT
GTCATATGGTATTGCCACTGTACGTGAAGTACTCTCTGACAGAGAGTTGCATCTTTCATG
GGAGGTTGGAAAACCTAGACCACCATTGAATAGAAATTATGTCTTTACTGGTTACCGTGT
AACTAAAAATAGTAAAGTACAGATTGGAGAGTACACCTTTGAAAAGGGTGACTATGGTGA
TGCTGTTGTGTACAGAGGTACTACAACATATAAACTGAATGTTGGTGATTACTTTGTGTT
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GAGAATTACTGGCTTATACCCTACACTCAACATTTCAGATGAGTTTTCTAGCAATGTTGT
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GAG------GAGAACCCAAAACTGGAAGAGC-----------------------------
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CCTTGCCTGGATTATGCTGCTACAGTTTGCCTATTCTAACCGGAACAGGTTTCTGTATAT
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AGGCTTGATGTGGCTTAGCTACTTCGTTGCTTCTTTCAGGCTGTTTGCGCGCACCCGCTC
GATGTGGTCATTCAATCCAGAAACAAACATTCTTCTCAATGTGCCTCTTCGGGGGACAAT
TTTGACCAGACCGCTCTTGGAAAGTGAACTTGTCATCGGTGCTGTGATCATTCGTGGTCA
CTTGCGAATGGCTGGACACTCCCTAGGGCGCTGTGACATAAAGGATCTGCCAAAAGAGAT
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TGACCACTCAGGTAGCAACGACAATATTGCTTTGCTAGTACAGTAAGTGACAACAGATGT
TTCATCTTGTTGACTTCCAGGTTACAATAGCAGAGATATTGATTATCATTATGAAGACTT
TCAGGGTTGCCATTTGGAACCTTGACATACTAATAAGTTCAATAGTGAGACAATTATTTA
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------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
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------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
---------------------------------------------------AAACGAACA
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AGGGCAATTCACCATTTCATCCTCTTGCTGACAATAAATTCGCACTAACTTGCATTAGCA
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CCAAATTGAAGACCCATGTCCAATACATTACTATTCGGACTGGTATATA------AAAAT
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GGCCCAGAAGCTTCACTTCCCTATGGTGCTAACAAAGAAGGCATCATATGGGTCGCAACT
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GCCATCGTGCTACAACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAAGGG
AGCAGAGGCGGCAGTCAAGCCTCTTCTCGCTCCTCATCACGTAGTCGCGGTAATTCAAGA
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GAAACTGCCCTCGCGCTATTGCTGCTAGATAGACTGAACCAGCTAGAGAGCAAAGTTTCT
GGTAAAGGCCAACAACAACAAGGCCAAACTGTCACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGCATCC
AAAAAGCCTCGCCAAAAGCGTACGGCAACTAAGTCGTACAACGTCACTCAAGCATTTGGG
AGACGTGGTCCAGAACAAACCCAAGGAAACTTTGGGGACCAAGACTTAATCAGACAAGGA
ACTGATTACAAACACTGGCCGCAAATTGCACAATTTGCTCCAAGTGCCTCTGCATTCTTT
GGAATGTCACGCATTGGCATGGAAGTCACACCTTCGGGAACATGGCTGACTTATCATGGA
GCCATCAAATTGGATGACAAAGATCCACAATTCAAAGACAACGTCATACTGCTGAATAAG
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GCTGATTCAACTCAGGCATAAACACTCATGATGACCACACAAGGCAGATGGGCTATGTAA
ACGTTTTCGCAATTCCGTTTACGATACATAGTCTACTCTTGTGCAGAATGAATTCTCGTA
ACTAAACAGCACAAGTAGGTTTAGTTAACTTTAATCTCACATAGCAATCTTTAATCAATG
TGTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAG--------------
------------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------
---------------------------------
>DQ648857.1 Bat coronavirus (BtCoV/279/2005), complete genome
ATATTAGGTTTTTACCTACCCAGG--AAAAGCCAACCAA-TCTCGATCTCTTGTAGATCT
GTTCTCTAAACGAACTTTAAAA------TCTGTGTAGCTGTCGCTCGGCTGCATGCCTAG
TGCACTTACGCAGTATAAATATTAAT-AACTTTACTGTCGCTGACTGGATACGAGTAACT
CGTCCTTCTTCTGCAGACTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTTGCAGTCGATCATCAGCATAC
CTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGCTCTTGGTGTCAGC
GAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTGCCTGTTCTACAGGTTAGAGACGTGCTAGTGCGT
GGCTTCGGGGACTCTGTGGAAGAGGCCTTAGCGGAGGCACGTGAACATCTTAAAAATGGC
ACTTGTGGCTTAGTGGAGCTGGAGAAGGGCGTTTTGCCTCAGCTTGAACAGCCATATGTG
TTCATTAAACGTTCTGATGCCCAGGGCACCAATCACGGCTATAAGGTCGTTGAATTGGTT
GCAGAATTGGACGGCATTCAGTACGGTCGTAGCGGTACAACACTGGGAGTCCTCGTGCCA
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GGAGCTGGTGGCCATAGCTACGGCATCGATCTAAAGTCTTATGACTTAGGTGTCGAGCTG
GGCACTGATCCCATTGAAGATTATGAACAAAACTGGAACACTAAGCATGGTGGTGGTGTA
CTCCGTGAACTCATCCGTGAGCTCAATGGAGGTGCATTCACTCGCTATGTCGACAACAAC
TTCTGTGGCCCAGATGGGTACCCTCTTGAATGCATTAAAGACCTTCTCGCTCGCGCGGGT
AAGTCAATGTGCACTCTTTCTGAACAACTTGATTACATTGAGTCGAAGAGAGGTGTTTAC
TGCTGCCGTGAACATGAACATGAAATTGTTTGGTTCACTGAGCGCTCTGAGAAGAGCTAT
GAGCGTCAGACACCCTTCGAGATCAAGAGTGCCAAGAAATTTGACACTTTCAAAGGGGAA
TGCCCGAAGTTCGTATTTCCTCTTAATTCTAAAGTCAAAGTCATTCAACCGCGTGTTGAA
AAGAAAAAGACTGAAGGTTTCATGGGGCGCATTCGCTCTGTGTATCCTGTTGCCACTCCT
CAAGAGTGCAACGACATGCACTTGTCTACCTTGATGAAATGTAATCATTGTGATGAAGTT
TCATGGCAGACGTGCGACTTTCTAAAAGCCACTTGTGAACAATGTGGCACTGAAAATTTA
GTTTGTGAAGGACCCACTACGTGTGGATACCTACCTGCTAATGCTGTAGTAAAAATGCCT
TGCCCTGCTTGCCAAGACCCTGAAGTAGGCCCTGAGCATAGTGTTGCAGACTACCATAAC
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GTGTTTGCCTACGTTGGCTGCTACAACAAGCGTGCATACTGGGTTCCTCGTGCTAGTGCC
AATATAGGCGCAAGCCATACTGGCATTACTGGTGATAACGTGGAGACTCTGAATGAGGAT
CTTATGGAGATATTGAATCGCGACCGTGTTAATATTAACATTGTCGGCGATTTTCATTTG
AATGAGGAGGTTGCTATTATTTTGGCATCCTTTTCAGCATCTACGTGTGCTTTTGTTGAC
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AAAGTTACGCGTGGCAGAGCTAAGAAAGGAGCTTGGAACATTGGACAGGAAAAATCTATT
TTAACACCACTGTATGGTTTCCCCTCACAGGCTGCTGGTGTTATTAGATCAATTTTTACT
CGTGCACTTGACACAGCAAATCATTCCATTCCTGACCTTCAAAGAGCAGCTATTACCATC
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CTGCTCACCAACAGTGTCATCGTTATGGCGTATGTGACTGGTGGTCTTGTACAGCAAATA
ACACAGTGGTTGTCTAACATGTTAGGCACTACTGTTGACAAGCTCAAACCCGTATTTACA
TGGGTTGAGGCTAAACTCAGTGCAGGAATTGAATTTCTCAGGGATGCCTGGGAAATTCTA
AAATTTTTGGTTACAGGAGTGTTTGACATTGTTAAGGGTCAAATACAAGTGGCTTCAGAT
AATCTCAAGGAATGTGTAAAAGCTTTCCTTGATGTTCTTAACAAAGCACTTGAAATGTGC
ATTGACCAAGTCATAATCGCTGGTGCCAAGCTGAGAACACTCAACTTGGGCGAGGTCTTC
ATTGCACAGAGCAAGGGACTCTATCGTCAGTGTATTCGTGGCAAAGAACAGCTGCAATTA
CTCATGCCTCTTAGGGCACCAAAAGAAGTCACCTTCTTTGAGGGAGATTCACATGATACT
GTTTTCACCTCTGAAGAGGTTGTTCTTAAAAATGGTGAACTCGAAGCACTTGAGACACCA
GTTGACAGCTTTACTAATGGAGCTGTCATAGGCACACCAGTTTGTGTTAATGGCCTTATG
CTCTTAGAACTCAAAGACAAAGAGCAGTATTGTGCTTTGTCTCCTGGTTTGTTAGCCACA
AACAATGTCTTCAGTCTAAAAGGAGGTGCACCAGTTAAGGGTGTAACCTTTGGAGAAGAT
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GTAGACAAGGTGCTTAATGAGAAGTGTTCTGTCTACACTGTTGAGTCTGGTACTGAAGTT
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CTTCTTACCAATATGGGTATTGATCTTGATGAGTGGAGTGTAGCCACATTTTACTTGTTT
GATGATGCTGGTGAAGAAAAACTTTCTTCGCGTATGTATTGCTCCTTCTACCCTCCTGAT
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GAACATGAATATGGCACAGAGGATGACTATAAAGGCCTTCCTCTTGAATTTGGTGCATCA
ACCGAAATACAACAGGTTGATGAG---GAAGAAGAGGAAGACTGGCTTGAGGAAGCTATT
GCAGCA------------------------------------------------------
------------AAACCTGAACCAGAACCTCTGCCTGAAGAACCAGTTAATCAG------
------------TTTACTGGCTACTTAAAACTTACTGATAATGTTGCCATTAAGTGTGTT
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CATCTGAAACATGGTGGTGGTGTAGCGGGTGCTCTTAATAAGGCAACCAATGGTGCCATG
CAACAGGAGAGTGATGATTACATTAAGAAAAATGGACCACTTACAGTAGGTGGTTCATGT
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ATGTGTGTTGAGACAGTTCGCACACAAGTGTACTTCGCAGTCAACGACCAGGATCTTTAC
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GAG---------AATCTGGAGTTGAAAGAGCAACCAGCCGTAGAGACTCTTACACAAGAG
AATCTAGAACTGG-A-AGAGCTACCGGTTATAGAAAAACCCGTAGATGTGAAGT------
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GGTTATTATTATTTGCTGATATTAATGGTAAGTTATACCAAGATTCTCAGAATATGTTAA
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GTAGTGGTGACATTACTTGTGTTATAATACCTGCCAAGAAGGCTGGCGGTACTACAGAGA
TGCTTGCCAAGGCATTAAAGAAGGTGCCAGTTAGTGAGTATATAACTACATACCCCGGAC
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GTATGGATGTTAAAGCCTTGATGTCTACTATTCATCGTAGATACAAGGGTATTAAAGTTC
AAGAGGGAATCGTTGATTATGGTGTTCGGTTCTTTTTCTACACTAGTAAAGAGCCTGTAG
CTTCCATTATCACAAAGCTCAATTTATTGAATGAACCACTTGTTACTATGCCAATTGGTT
ATGTGACACATGGACTCAATTTGGAAGAGGCTGCTCGTTGTATGCGTTCTCTTAAAGCTC
CTGCTGTAGTTTCAGTGTCTTCACCAGATGCAGTTACTACATATAATGGATACCTTACAT
CGTCTTCGAAGACGTCTGAGGAACATTTTATAGAGACTGTTTCCCTTGCAGGTATGTATA
GGGATTGGTCATACTCAGGACAACGTACAGAGTTAGGTGTTGAATTTCTTAAGCGTGGCG
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TCTTGCTTGACAAACTTAAGAGTCTTTTATCTCTTCGTGAGGTTAGGACTATTAAAGTGT
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GACAGCAGTTTGGTCCTACTTACTTGGACGGTGCTGATGTTACAAAGATTAAACCACATG
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CATTTGAATATTACCATACTCTCGATGAGAGTTTTCTTGGTAGATATATGTCTGCTTTAA
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ATAACAATTGTTATTTGTCCAGTGTTTTATTAGCACTTCAGCAGATTGAAGTGAAGTTTA
ATGCACCCGCACTACAAGAAGCCTATTATAGAGCTCGTGCTGGTGATGCAGCCAATTTTT
GTGCGCTTATACTCGCCTATAGTAATAGAACTGTAGGTGAGTTAGGTGATGTTAGAGAAA
CTATGACTCATCTTTTACAGCACGCTAATTTAGAATCAGCTAAGAGAGTTCTTAATGTGG
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TGGGCACATTGTCCTATGAAGAACTTAAGACAGGTGTTACTATTCCATGTATATGTGGGC
GTGATGCTACACAATATCTAGTACAACAGGAGTCTTCTTTTGTTATGATGTCTGCACCAC
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ATCAGTGTGGTCATTATACACATGTAACTGTTAAGGAAACGCTTTATCGTATAGATGGGG
CGTACCTCACTAAAATGTCAGAATATAAAGGACCAGTGACTGATGTTTTCTATAAGGAAA
TATCTTACACTACGACTATTAAGCCTGTGTCATATAAGCTCGATGGAGTTATTTACACAG
AGATTCAACCAAAATTAGATGAGTATTACAAGAAGGATAATGCTTACTACACAGAGCAAC
CCATTGATCTTGTGCCAACTCAGCCTTTACCAAATGCGAGTTTTGACAATTTCAAACTCA
CATGCTCAAACACTAAGTTTGCTGATGATCTTAATCAAATGACGGGCTTCAAAAAGCCAG
CTTCACGTGAGCTATCTGTCACATTCTTCCCAGACTTGAATGGCGATGTAGTGGCTATTG
ACTATAGACATTACTCAGCGAGTTTCAAGAAAGGTGCTAAATTGCTACACAAGCCAATTA
TTTGGCATATCAATCAGACTACAAACAAGACAACCTATAAGCCAAACACTTGGTGTTTAC
GTTGTCTTTGGAGCACAAAGCCAGTTGAAACTTCAAATTCATTTGAAGTTCTGGAAGTAG
AAGACACACAAGGAATGGACAATCTTGCTTGTGAAAGTCAAACACCCACCTCTGAAGAAG
TAGTGGAAAATCCTACCATACAGAAGGAAGTTATAGAGTGTGACGTGAAAACTATCGAAG
TTGTAGGTAATGTCATACTTAAACCATCAGAAGAAGGCGTCAAAGTGACACAAGAGTTAG
GTCATGAAGATTTAATGGCTGCCTATGTGGAAGAAACAAGCATTACTATTAAGAAACCTA
ATGAGCTGTCACTAGCCCTAGGTCTTAGAACTCTTGCCACTCATGGTGCTGCTGCAATAA
ATAGTGTGCCCTGGAGTAAAATTTTGGCATATGTCAAACCTTTTCTAGGACAAGCGGCAG
TGACAACCACAAACTGCATTAAAAGATGTGTGCAGCGTGTCTTTAACAACTATATGCCTT
ATGTTATCACATTATTATTTCAATTGTGTACCTTTACAAGAAGTACCAATTCAAGAATTA
GAGCCTCACTTCCTACAACTATAGCTAAAAATAGTGTTAAGAGTGTTGCAAAATTGTGTT
TGGATGTTTGCATTAACTATGTGAAATCTCCTAAATTTTCTAAATTGTTCACAATTGCAA
TGTGGCTATTGTTGTTAAGTATTTGCCTAGGTTCATTAATCTATGTAACTGCAGCTTTTG
GTGTACTCTTATCTAATTTAGGTATTCCTTCTTATTGTGATGGTGTTAGAGAGTCATATG
TTAACTCTTCTAATGTCACCACTATGGATTTCTGCGAGGGTTCTTTTCTATGCAGTGTTT
GCTTAAATGGGTTGGATTCCCTTGATTCTTACCCAGCTCTAGAGACCATTCAGGTTACGA
TTTCTTCGTACAAACTAGACCTTACATCTTTAGGTTTGGCAGCTGAGTGGTTTTTGGCAT
ATATGTTGTTTACAAAGTTCTTTTACTTACTTGGTCTCTCTGCTATAATGCAGGTGTTCT
TTGGCTATTTTGCTAGTCATTTCATCAGCAACTCATGGCTTATGTGGTTCATCATTAGCA
TTGTACAGATGGCACCCGTTTCCGCAATGGTTAGGATGTACATTTTCTTTGCTTTTTGCT
ACTATGTGTGGAAAAGCTATGTTCATATTATGGATGGTTGCACCTCTTCGACTTGCATGA
TGTGCTATAAGCGCAATCGTGCTACACGTGTTGAGTGCACAACCATTGTTAATGGCATGA
AGAGATCCTTCTATGTCTATGCTAACGGAGGACGAGGCTTCTGTAAGGCTCACAATTGGA
ATTGTCTCAACTGTGATACATTTTGTGCTGGTAGTACTTTCATTAGCGATGAAGTTGCTC
GTGATTTGTCACTCCAGTTTAAAAGACCAATTAACCCCACAGACCAGTCTTCTTATGTTG
TTGATAGTGTTGCTGTCAAGAATGGTGCACTCCATCTTTACTTTGACAAGGCTGGTCAAA
AGACTTACGAGAGACACCCACTCTCTCACTTCGTCAATTTAGACAATCTGAGAGCTAATA
ACACTAAGGGCTCATTACCCATTAATGTTATTGTTTTTGATGGCAAGTCCAAATGTGACG
AGTCAGCTGCAAAGTCTGCATCTGTTTATTACAGTCAGCTTATGTGCCAACCTATTCTGC
TGCTTGACCAGGCTCTCGTTTCAGATGTTGGTGATAGTACTGAAGTTTCTGTTAAAATGT
TTGATGCTTATGTCGATACTTTTTCAGCAACTTTCAGTGTTCCTATGGAAAAACTAAAAG
CACTTGTTGCAACTGCCCATAGCGAGTTGGCAAAGGGTGTTGCTCTAGATGGTGTCCTGT
CTACATTTGTCTCAGCCGCACGCCAAGGTGTCGTTGATACTGATGTCGATACAAAGGATG
TCATTGAGTGTCTCAAACTCTCCCACCATTCTGATTTAGAAGTGACAGGTGACAGTTGTA
ATAACTTCATGCTCACCTACAACAAAGTTGAGAACATGACGCCTAGAGACCTTGGTGCAT
GTATTGATTGCAATGCAAGGCATATTAATGCCCAAGTAGCAAAAAGTCACAATGTTTCGC
TCATCTGGAACGTCAAAGACTATATGTCTTTGTCTGAACAGTTGCGCAAGCAAATTCGTA
GCGCTGCCAAAAAGAACAACATACCTTTTAGGTTAACTTGTGCTACTACTAGACAGGTTG
TCAATGCCATAACCACTAAAATCTCACTTAAGGGTGGTAAGATTGTTAGTACTTGGTTCA
AACTTATGTTGAAAGCCACACTATTGTGTGTTCTCGCTGCATTGTTCTGCTACATCATTA
TGCCAGTACATTCATTGTCTGTTCATGATGGTTACACAAATGAAATCATAGGATACAAAG
CCATTCAGGACGGTGTCACTCGTGATATCATGGCTACCGATGATTGCTTTGCTAATAAAC
ATGCTGGATTCGACTCATGGTTTAGCCAGCGTGGCGGTTCCTACAGAAATGACAAAAGCT
GCCCTGTTGTAGCCGCTATCATTACTAGAGAAATTGGTTTCATAGTGCCTGGTTTACCTG
GTACTGTTCTGAGAGCAATTAATGGAGACTTTTTGCATTTTCTACCTCGTGTTTTCAGTG
CTGTTGGCAATATTTGCTACACACCATCAAAACTTATTGAGTATAGTGATTTTGCTACTT
CTGCTTGCGTCTTGGCTGCTGAATGTACAATCTTTAAGGATGCTATGGGTAAACCTGTGC
CGTACTGCTACGACACTAACTTGCTTGAGGGTTCTATTTCCTATAGTGAGCTTCGTCCTG
ACACTCGTTATGTGCTTATGGACGGTTCTATTATACAATTCCCTAACACTTACTTGGAAG
GTTCTGTTAGAGTGGTTACAACTTTTGATGCGGAGTACTGTAGGCATGGTACTTGTGAAA
GGTCAGAAGCTGGTGTTTGCCTGTCTACTAGTGGCAGATGGGTTCTTAACAATGAGCATT
ACAGAGCTCTACCAGGAGTATTCTGTGGTGTCGATGCAATGAATCTTATAGCCAACATCT
TTACACCTCTTGTTCAACCTGTTGGTGCTTTAGATGTATCAGCTTCTGTAGTAGCGGGTG
GTATCATTGCCATATTGGTGACTTGTGCTGCTTACTACTTTATGAAATTCAGACGTGCAT
TTGGTGAGTACAACCATGTTGTAGCTGCTAATGCATTGCTGTTTTTAATGTCTTTCACTA
TACTCTGCCTGGCACCTGCTTATAGCTTTTTGCCAGGAGTTTATTCTATCTTTTACTTGT
ACTTGACATTCTATTTCACTAATGATGTTTCATTCTTGGCTCACCTTCAATGGTTTGCCA
TGTTTTCTCCAATCGTGCCTTTCTGGATAACAGCAATCTATGTGTTCTGTATTTCTCTAA
AGCACTGTCATTGGTTCTTTAATAACTATCTTAGGAAAAGAGTCATGTTTAATGGAGTTA
CATTTAGCACCTTTGAGGAGGCAGCTTTGTGTACCTTTTTACTTAATAAGGAGATGTACC
TGAAACTGCGTAGTGAGACATTATTGCCACTTACACAGTACAACAGATATCTCGCTCTCT
ATAACAAGTACAAGTATTTCAGTGGAGCCTTAGACACAACTAGCTATCGTGAAGCAGCTT
GCTGTCACTTAGCAAAGGCTCTTAATGATTTTAGCAACTCCGGTGCTGATGTTCTCTACC
AACCACCACAAACTTCAATTACTTCTGCTGTTTTGCAGAGTGGTTTTAGGAAAATGGCAT
TCCCATCTGGTAAAGTTGAAGGATGCATGGTACAAGTCACCTGTGGAACTACAACCCTAA
ATGGTTTGTGGCTAGATGACACAGTGTATTGTCCAAGACATGTCATTTGCACGGCGGAAG
ACATGCTCAATCCTAACTATGAAGACTTGCTCATTCGCAAATCTAATCATAGTTTCCTGG
TTCAAGCTGGTAATGTTCAACTCCGTGTTATTGGCCATTCCATGCAAAACTGTTTACTTA
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------------------------------------------------------------
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GTGTACAACTTCACAATGACATTCTTCTTGCAAAGGACACTACTGAAGCTTTTGAAAAGA
TGGTTTCACTTTTGTCCGTTCTGCTATCCATGCAGGGTGCTGTAGACATTAATAAGTTGT
GCGAAGAAATGCTTGACAACCGTGCTACTCTTCAGGCCATCGCTTCAGAATTTAGTTCTT
TACCTTCGTATGCTGCTTATGCCACTGCCCAAGAGGCTTATGAGCAAGCTGTATCAAATG
GTGATTCTGAAGTTGTTCTTAAGAAGTTAAAGAAATCTTTGAATGTGGCTAAATCTGAGT
TTGACCGTGATGCTGCCATGCAACGTAAGTTGGAAAAGATGGCAGATCAAGCTATGACCC
AAATGTACAAGCAGGCAAGATCTGAAGACAAGCGGGCAAAAGTAACTAGTGCAATGCAAA
CGATGCTTTTCACTATGCTTAGAAAACTTGATAATGATGCACTTAACAACATTATCAACA
ATGCACGTGATGGTTGTGTACCACTCAACATCATACCACTTACAACAGCAGCTAAACTCA
TGGTTGTTGTCCCTGACTATGGAACCTACAAGAACACTTGTGATGGTAACACTTTCACAT
ATGCGTCAGCACTCTGGGAAATTCAGCAAGTTGTTGATGCAGATAGTAAAATTGTCCAGC
TCAGTGAAATCAATATGGACAACTCATCAAACTTGGCTTGGCCTCTTATTGTTACTGCAC
TAAGAGCCAACTCAGCTGTCAAACTACAGAATAATGAACTGAGTCCAGTAGCATTACGAC
AGATGTCTTGTGCGGCTGGTACTACGCAAACAGCTTGTACTGATGACAATGCACTCGCCT
ATTACAACAATGCAAAGGGAGGTAGGTTTGTGCTTGCATTACTATCAGACCATCAGGACC
TCAAGTGGGCTAGATTCCCTAAGAGTGATGGTACAGGTACTATCTATACAGAACTGGAAC
CACCTTGCAGGTTTGTTACAGACACACCTAAAGGACCTAAAGTGAAGTATTTGTACTTTA
TTAAGGGTCTTAACAACCTAAATAGAGGTATGGTACTGGGTAGTTTGGCTGCCACAGTAC
GTCTTCAGGCCGGTAATGCGACAGAAGTGCCTGCCAATTCAACTGTGCTTTCTTTCTGTG
CTTTCGCTGTAGATCCAGCTAAAGCTTACAAAGATTACTTAGCAAGTGGTGGACAACCAA
TCACGAATTGTGTGAAGATGTTGTGTACCCACACCGGTACAGGACAGGCAATCACGGTAA
CACCAGAAGCCAATATGGATCAAGAGTCCTTTGGTGGTGCTTCATGCTGTCTGTATTGTA
GATGCCACATTGATCATCCAAATCCTAAGGGATTTTGTGACTTGAAAGGTAAGTATGTCC
AAATACCTACCACTTGTGCTAATGACCCTGTGGGTTTCACACTCAGAAACACAGTCTGTA
CCGTCTGCGGAATGTGGAAAGGTTATGGCTGTAGTTGTGATCAACTCCGCGAACCCATGA
TGCAGTCTGCGGACGCGTCAACGTTTTTAAACGGGTTTGCGGTGTAAGTGCGGCCCGTCT
TACACCGTGCGGCACAGGCACTAGTACTGATGTCGTTTATAGGGCTTTTGATATTTACAA
CGAGAAAGTTGCTGGTTTTGCAAAGTTCCTAAAGACTAATTGCTGCCGCTTCCAAGAAAA
GGATGAGGAAGGCAATTTATTAGACTCTTATTTCGTAGTTAAGAGGCACACAATGTCCAA
CTACCAACATGAAGAGACTATTTACAACTTGATTAAAGAGTGTCCAGCCGTTGCTGTTCA
TGACTTTTTCAAGTTTAGAGTGGATGGTGACATGGTACCACATATATCACGTCAACGTCT
AACTAAATACACAATGGCTGATTTAGTCTATGCTCTACGTCATTTTGACGAGGGCAATTG
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GAAGGATTGGTATGATTTTGTAGAAAATCCTGATGTTCTACGCGTATACGCGAACCTAGG
TGAGCGTGTACGTCAAGCCTTACTGAAGACTGTGCAATTCTGCGATGCTATGCGTGACGC
GGGTATCGTAGGTGTACTGACACTAGATAATCAGGATCTGAATGGGAATTGGTACGATTT
CGGAGACTTCGTACAGGTAGCACCAGGCTGCGGGGTTCCTATTGTGGATTCATACTATTC
TTTGCTGATGCCTATCTTGACACTCACAAAGGCCTTAGCTGCTGAGTCCCATATGGACGC
TGACCTCGCGAAGCCACTTGTAAAGTGGGATTTGCTCAAATATGATTTCACGGAAGAGAG
ACTATGTCTTTTTGACCGTTATTTTAAATATTGGGATCAGATATATCATCCTAATTGTAT
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TGTGTTTCCACCTACGAGTTTTGGACCACTAGTAAGAAAGATTTTTGTAGATGGTGTACC
TTTTGTTGTTTCAACGGGATACCATTTTCGTGAGCTAGGGGTTGTACATAATCAGGATGT
AAACTTACATAGCTCACGCCTCAGTTTTAAGGAACTTTTAGTGTACGCTGCTGATCCTGC
TATGCATGCTGCCTCTGGCAATTTGTTGTTAGATAAACGCACTACATGCTTTTCAGTAGC
TGCACTAACAAATAATGTTGCTTTTCAAACTGTCAAACCCGGTAATTTTAATAAAGACTT
TTATGACTTTGCTGTGTCTAAAGGCTTCTTTAAGGAAGGAAGTTCTGTTGAATTAAAACA
CTTCTTCTTTGCTCAGGATGGCAATGCTGCTATCAGTGATTATGACTATTACCGTTATAA
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CTTTGATTGTTACGATGGTGGCTGTATCAATGCCAACCAAGTTATCGTTAACAATCTGGA
CAAATCAGCTGGTTTCCCATTTAACAAGTGGGGTAAGGCTAGACTTTATTATGACTCAAT
GAGTTATGAGGATCAAGATGCATTGTTCGCATACACTAAGCGTAATGTCATCCCTACAAT
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TGTCTCTATCTGTAGTACTATGACCAATAGACAGTTTCATCAGAAATTATTAAAGTCAAT
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TGTCCGCAATCTTCAACATAGACTTTATGAGTGTCTCTATAGAAACAGAGATGTAGATCA
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AGCAGAGGCGGCAGTCAAGCCTCATCTCGCTCTTCATCACGTAGTCGCGGTAATTCAAGA
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GAAACTGCCCTTGCGCTATTGCTGCTAGACAGATTGAACCAGCTTGAGAGCAAAGTTTCT
GGTAAAGGCCAACAACAACAAGGCCAAACTGTCACCAAGAAATCTGCTGCTGAGGCATCT
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GCTGATTCAACTCAGGCATAAACACTCATGATGACCACACAAGGCAGATGGGCTATGTAA
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TGTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTAC
GATCGAGGGTACAGTGAATAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTG
TAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGAC
---------------------------------
>GQ153548.1 Bat SARS coronavirus HKU3-13, complete genome
--GTTAGGTTTTTACCTACCCAGG--AAAAGCCAACCAA-CCTTGATCTCTTGTAGATCT
GTTCTCTAAACGAACTTTAAAA------TCTGTGTGGCTGTCGCTCGGCTGCATGCCTAG
CGCACCTACGCAGTATAAATATTAAT-AACTTTACTGTCGTTGACAAGAAACGAGTAACT
CGTCCCTCTTCTGCAGACTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTTGCAGTCGATCATCAGCACAC
CTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTTCTTGGTGTCAAT
GAAAAAACACACGTCCAACTCAGTTTGCCTGTTCTTCAGGTTAGAGACGTGCTAGTGCGT
GGCTTCGGGGACTCTGTGGAAGAGGCCTTATCGGAGGCACGTGAACATCTTAAAAATGGC
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TTCATTAAACGATCTGATGCTCTAAGCACCAATCACGGCCACAAGGTTGTGGAATTGGTT
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CACGTGGGCGAAACCCCAATCGCATACCGTAATGTTCTTCTCCGTAAGAATGGTAATAAG
GGAGCCGGTGGTCATAGTTTTGGCATCGATCTAAAGTCTTATGACTTAGGTGACGAACTT
GGCACTGATCCCATTGAAGATTATGAACAAAACTGGAACACTAAGCATGGCAGTGGTGCT
CTTCGTGAACTCACTCGTGAGCTCAATGGAGGTGTAGTCACTCGTTATGTTGATAACAAC
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TGCTGCCGTGAACATGAACATGAAATTGTTTGGTTCACTGAACGCTCTGAAAAGAGCTAT
GAGCACCAGACACCCTTCGAGATTAAGAGTGCCAAGAAATTTGACACCTTTAAAGGGGAA
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GTATTTTCCTATGTTGGCTGCTATAACAAGCGAGCCTACTGGGTCCCTCGTGCTAGTGCT
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CTTCTGGAGATACTGAATCGCGAACGTGTTAACATTAACATTGTTGGTGATTTTCGGTTT
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CTTGATGGTATTTCTGAACAATCATTGCGTCTTGTTGATGCCATGGTTTACACCTCAGAT
TTGTTAACCAACAGTGTTGTCGTTATGGCATATGTGACTGGTGGTCTTGTACAACAAACG
ATGCAGTGGTTGTCTAACATGCTAGGCACTGCTGTTGACAAGCTAAAACCCGTGTTTACA
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AAATTCTTGATCACAGGAGTATTTGATGTCATTAAGGGTCAAATACAGGTTGCTACAGAT
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TTAGACCAGGTCACGATTGCTGGCACTAAGTTGAGAGCGCTCAATTTAGGTGAAGTCTTC
ATTGCACAAAGCAGAGGACTCTACCGCCAGTGTATTCGTGGCAAAGAACAGCTGCAATTA
CTCATGCCTCTTAAGGCACCAAAAGAAGTCACCTTCCTTGAAGGAGATGCACATGATACA
GTACTAACCTCTGAAGAGGTCGTCCTTAAGAGTGGTGAGCTCGAGGCACTAGAGACACCA
ATTGACAGCTTCACTAGTGGAGCTGTTGTAGGTACACCTGTTTGTATCAATGGCCTCATG
CTCTTAGAGCTCGAGAATAAGGAACAGTATTGTGCCTTGTCTCCTGGCTTGTTAGCAACA
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GACGACGCTGGTGAAGAAAAACTTTCATCACGCATGTATTGCTCTTTCTACCCTCC----
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GAACATGAATATGGCACAGAGGATGACTATAAAGGTCTCCCTCTTGAATTTGGTGCATCA
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GAAGCA------------------------------------------------------
------------GAACCTGAACCAGAACCTCTACCTGAAGAACCAGTCAATCAG------
------------TTTGTTGGTTATTTAAAGCTTACTGACAATGTTGCCATTAAGTGTATT
GACATTGTTAAAGAGGCACAAAGTGCTAAACCAACAGTGATTGTTAATGCTGCTAACACC
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AATTGTTGACACAGTGAGTGCCTTAGTTTATGACAATAAGCTAAAAGCACACAAGGAGAA
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AATCAACAGGCCACAAATAGGTGTAGTAAGAGAATTTCTTACGCGCAACCCTGCTTGGAG
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GTTGCCCACTCAAACTGTTGATTCTTCACAGGGTTCTGAATATGACTATGTCATATTCAC
ACAAACCACTGAGACTGCACACTCTTGTAATGTAAACCGCTTTAATGTGGCCATCACAAG
AGCAAAAATTGGCATTTTGTGTATAATGTCTGATAGAGACCTTTATGACAAGCTGCAATT
TACGAGTCTAGAAGTACCACGCCGAAATGTGGCTACTTTACAAGCAGAAAATGTGACTGG
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TAATGGTTACCCTAATATGTTTATCACCCGTGAAGAAGCTATTCGTCACGTTCGTGCATG
GATAGGCTTTGATGTAGAGGGTTGTCATGCTACTAGAGATGCTGTAGGAACAAATCTACC
ACTCCAGTTAGGGTTTTCAACAGGTGTTAACCTAGTGGCCGTACCGACTGGCTATGTTGA
CACTGAAAATAGCACAGAATTCACCAGAGTTAATGCAAAACCTCCTCCAGGTGATCAATT
TAAGCATCTTATACCACTTATGTACAAAGGTTTGCCCTGGAACGTGGTGCGTATTAAGAT
TGTTCAAATGCTCAGTGATACGCTGAAAGGATTATCAGACAGAGTTGTGTTTGTCCTCTG
GGCACATGGCTTTGAACTCACATCGATGAAGTACTTTGTCAAGATTGGACCAGAAAGAAC
GTGTTGTCTGTGTGACAAGCGTGCAACTTGCTTCTCCACTTCATCTGATACTTATGCCTG
CTGGAATCACTCTGTGGGTTTTGACTATGTCTACAACCCGTTTATGATTGATGTACAGCA
GTGGGGTTTTACAGGTAACTTGCAGAGTAACCACGATCAGCACTGCCAAGTGCATGGTAA
TGCTCATGTAGCTAGTTGTGATGCTATCATGACTAGATGTCTCGCAGTCCATGAGTGCTT
CGTTAAGCGCGTCGATTGGTCTGTTGAATATCCGATTATCGGAGATGAACTGAAGATCAA
CGCCGCATGCAGAAAAGTACAGCATATGGTTGTCAAGTCTGCATTGCTTGCTGATAAATT
TACAGTTCTTCATGACATTGGAAACCCAAAGGCAATTAGATGTGTGCCGCAGGCTGAAGT
AGACTGGAAATTCTACGACGCTCAGCCTTGCAGTGACAAAGCTTATAAAATAGAAGAACT
CTTCTACTCATATGCCACACATCATGACAAGTTCACAGATGGTGTCTGTTTGTTTTGGAA
CTGTAACGTTGATCGTTACCCAGCCAATGCTATTGTGTGTAGGTTTGATACCCGAGTGCT
CTCTAATTTAAACCTACCTGGTTGTGATGGTGGTAGTTTGTATGTTAATAAGCATGCATT
CCACACTCCAGCTTTTGATAAGAGTGCATTTACACATTTGAAGCAACTGCCTTTCTTTTA
TTATTCTGACAGTCCTTGTGAGTCTCATGGTAAACAGGTCGTGTCAGACATTGATTATGT
CCCACTAAAGTCTGCTACGTGTATTACACGCTGCAACTTAGGTGGTGCTGTTTGTAGACA
TCATGCAAATGAGTATAGACAGTACTTGGAAGCATACAATATGATGATTTCTGCTGGATT
TAGCCTTTGGATTTATAAACAATTTGATACTTACAACTTGTGGAATACTTTCACTAAGTT
GCAGAGTTTAGAAAATGTGGCATATAATGTTGTCAACAAGGGACACTTTGATGGACAGAG
TGGTGAAGCACCTGTATCCATCATTAATAATGCTGTTTACACTAAAGTAGATGGCATTGA
CGTGGAAATTTTCGAGAACAAGACAACACTTCCTGTTAATGTGGCGTTTGAGCTTTGGGC
CAAGCGTAACATTAAACCAGTGCCTGAGATTAAGATACTCAATAATTTGGGTGTCGACAT
CGTCGCTAATAATGTTATCTGGGACTATAAAAGAGAAGCCCCAGCGCATGTTTCTACAAT
AGGTGTCTGTACAATGACTGACATTGCAAAGAAACCTACTGAGAGTGCTTGTTCATCACT
CATTGTCTTGTTTGACGGTAGAGTTGAGGGACAGGTAGACTTTTTCAGAAATGCTCGCAA
TGGTGTTTTAATAACAGAAGGTTCAGTTAAGGGCTTAACACCTTCGAAAGGACCCGCACA
AGCTAGTGTCAATGGAGTCACATTAATTGGAGAATCAGTAAAAACACAGTTTAATTATTT
TAAGAAAGTGGATGGCATAATTCAGCAATTGCCGGAAACCTACTTTACTCAAAGCAGAGA
CTTAGAGGATTTCAAGCCCAGATCACAAATGGAAACTGATTTCCTCGAGCTCGCAATGGA
TGAGTTCATACAACGGTATAAGCTAGAGGGCTATGCTTTCGAGCATATCGTTTATGGAGA
TTTCAGTTATGGACAACTTGGCGGGTTGCATCTAATGATTGGTCTAGCCAAGCGCTCACA
AGATTCACTGCTTAAACTAGAGGATTTTATCCCTATGGATAGCACAGTGAAAAATTACTT
CATAACAGATGCTCAAACAGGTTCATCAAAATGTGTCTGCTCTGTTATTGATCTTTTACT
TGATGACTTTGTTGAAATAATAAAGTCACAAGACCTTTCAGTAGTTTCAAAAGTGGTCAA
AGTTACAATTGACTATGCTGAAATATCATTTATGCTTTGGTGTAAGGATGGACATGTTGA
AACCTTCTACCCAAAATTACAGGCAAGTCAAGCATGGCAACCAGGTGTCGCTATGCCTAA
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TGCTGTCATACCAAAAGGAATAATGATGAATGTTGCAAAATATACCCAACTGTGTCAATA
CTTAAACACACTTACATTAGCTGTGCCTTATAACATGAGAGTGATACACTTTGGTGCAGG
CTCTGATAAAGGAGTAGCACCCGGTACAGCTGTTCTCAGGCAGTGGTTGCCAACTGGCAC
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CCCTAAGACCAAACATGTGTTAAAGGATAATGACTCAAAAGAGGGGTTTTTCACTTATCT
ATGTGGATTTATTAAACAAAAACTAGCCCTGGGAGGTTCTGTAGCTGTTAAGATAACAGA
GCATTCTTGGAATGCCGATCTTTACAAGCTTATGGGACATTTCTCATGGTGGACAGCCTT
TGTTACAAATGTAAATGCATCATCATCAGAAGCATTTTTAATTGGAGTTAACTATCTTGG
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TTGTAGGCAACGTTATACTAAAGCCAGCAGAAGAAGGTGTTAAAATCACACCAGAGTTGG
GTCATGAAGATCTAATGGCTGCTTATGTTGAAGAAACAAGCATTACCATTAAGAAGCCTA
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GTGTATGCCTGTCTAGTTTAGGTGTTCCTTCTTATTGTGATGGCGTTAGAGAGTTGTATA
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CTTTTGAGAGAGATCTGTCT---------------TCTGATGATGG--------------
----------TAATGGTGTATATACACTTTCAACTTATGACTTTAACCCTAATGTTCCAG
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CAGTTTGTGGACCTAAACTGTCCACACAACTAGTTAAGAACCAGTGTGTTAATTTCAACT
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---TACGTAGTACCGGCCAGAAGTCAATTGTTGCCTATACTATGTCATTGGGTGCTGAAA
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>MN908947.3 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate Wuhan-Hu-1, complete genome
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GCAATCGTGCTACAACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAAGGG
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GGTAAAGGCCAACAACAACAAGGCCAAACTGTCACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGCTTCT
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GCTGATGAAACTCAAGCCTTACCGCAGAGACAGAAGAAACAGCAAACTGTGACTCTTCTT
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GCTGACTCAACTCAGGCCTAA--ACTCATGCAGACCACACAAGGCAGATGGGCTATATAA
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TAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGAC
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